Les pastèques jaunes manquent de lycopène, qui est le produit chimique qui produit une couleur rougeâtre dans les fruits et légumes comme les tomates et le pamplemousse rouge. Alors que les grandes quantités de lycopène dans la pastèque rouge lui donnent un intérieur rouge rosé, le manque de lycopène dans la pastèque jaune donne une couleur jaunâtre.